Courage, le chien froussard suit les aventures d'un chien nommé Courage, un canin anthropomorphe très impressionnable vivant dans une ferme en compagnie de ses deux maîtres, Murielle et Eustache Eubagge près d'une ville fictive nommée Nulle-Part, localisée dans le Kansas. Abandonné alors qu'il n'était qu'un jeune chiot, Courage a été adopté par Muriel Eubagge (une gentille retraitée d'origine écossaise) et son mari Eustache (un fermier antipathique qui adore effrayer Courage la plupart du temps à l'aide d'un masque de monstre). Courage, Eustache et Murielle sont fréquemment menacés par des monstres, des extraterrestres, démons, scientifiques fous, zombies, et autres types d'antagonistes dont Courage doit sauver ses maîtres. Parmi les créatures auxquelles ces trois personnages doivent faire face, certains d'entre eux étaient en détresse et cherchaient simplement à être aidés.
En commandant de nouveaux rideaux, Muriel reçoit des graines en cadeau. Elle les plante et obtient un arbre magique qui réalise les vœux. Exaspéré, Eustache le fermier veut le couper. Courage fait tout son possible pour sauver l'arbre.
Shirley revient à la ferme, déguisée en mendiante. Muriel et Courage lui donnent chacun quelque chose, mais Eustache lui claque la porte au nez. Elle lui jette alors un sort qui ne pourra être levé que s'il apprend à donner de sa personne
Muriel vient d'apprendre qu'elle a gagné le concours du meilleur joueur de sitar et doit se produire au Music Hall. Toute la famille se rend à New York.
La famille est enterrée sous 1 000 ans de sédiments après qu'un météore géant a rebondi sur la Terre, la faisant tournoyer jusque dans le futur. Courage la déterre et la ramène à la surface, pour découvrir un monde d'êtres bananes.
Une momie revient d'entre les morts pour se venger des deux personnes qui l'ont enterrée il y a des milliers d'années, deux personnes qui ressemblent étrangement à Muriel et Eustache. Ceux-ci décident de remonter le temps pour connaître la vérité.
Un sinistre marchand ambulant d'aspirateurs arrive à la ferme. Pendant qu'il débite ses boniments, ce marchand rétrécit Muriel et Eustache et les aspire avec son aspirateur. Courage doit trouver un moyen de les sauver.
Courage et sa famille sont sélectionnés par la NASA pour effectuer une dangereuse mission spatiale pour sauver le soleil. Pendant le vol, Muriel est infectée par une bactérie extraterrestre qui tente de saboter la mission.
Le petit voisin transforme accidentellement Courage en mouche en faisant des tests avec sa panoplie de scientifiques. Tandis qu'il bourdonne aux alentours, il entend du personnel militaire parler d'un satellite secret qui serait en train de chuter sur la Terre, directement sur la ferme.
C'est le retour de Katz dans un rôle de méchant confiseur, déterminé à éliminer sa principale concurrente dans la course au premier prix du Concours des meilleurs bonbons de Nullepart : Muriel. Il concocte une confiture mutante qui l'avale et la kidnappe.
La plus grande loterie de l'histoire de Nullepart est sur le point d'être organisée et Muriel et Eustache attendent avec impatience de savoir s'ils ont gagné. Mais leur télévision tombe en panne et le réparateur arrive sous les traits du chef : Le Couac.
L'ordinateur décide de prendre le contrôle du corps de Muriel, afin de montrer au monde de quoi il est capable. Courage est horrifié de voir que Muriel effectue des acrobaties très risquées et passe au journal télévisé de Nullepart.
Le Fermier voit un reportage à la télévision, sur une casquette perdue dorée qui vaut des millions. Il décide d'emmener la famille partir à la recherche de cette casquette.
La famille embarque pour une croisière, mais au lieu de profiter de ses vacances, elle se retrouve à devoir officier en tant qu'équipage. Emmenée par le farouche capitaine Sharky, elle est forcée de l'aider alors qu'il chasse un serpent de mer malfaisant.
En creusant près de la ferme, Courage déterre un os de kangourou géant, que le docteur Vindaloo greffe au fermier lors d'une opération du dos. Cette greffe transforme Eustache en monstrueux kangourou géant, qui sème le chaos et la destruction.
Après avoir écouté une histoire de Muriel, Courage rêve qu'il est un shérif courageux embauché par la ville de Nullepart pour protéger sa population d'un hors-la-loi.
Muriel et Eustache manquent d'écraser un charançon avec leur camion, ce qui pousse Muriel à inviter l'insecte à la ferme pour se qu'il se remette de ses blessures. Le charançon s'avère être un diplômé d'Oxford très raffiné et un hôte idéal.
Une baleine de sable géante arrive à la ferme et demande qu'on lui rende son accordéon, que le père d'Eustache avait gagné lors d'une partie de cartes truquée, des années auparavant. Eustache refuse de le rendre, car l'instrument a une valeur sentimentale pour lui.
Des boulets de canon roses tombent d'une immense tour sur la population de Nullepart, ce qui les rend gris et déprimés. C'est le Docteur Zalost, un scientifique sinistre qui est à l'origine de ce complot. Il est tellement malheureux, qu'il veut que tout le monde soit aussi malheureux que lui.
