Courage, le chien froussard suit les aventures d'un chien nommé Courage, un canin anthropomorphe très impressionnable vivant dans une ferme en compagnie de ses deux maîtres, Murielle et Eustache Eubagge près d'une ville fictive nommée Nulle-Part, localisée dans le Kansas. Abandonné alors qu'il n'était qu'un jeune chiot, Courage a été adopté par Muriel Eubagge (une gentille retraitée d'origine écossaise) et son mari Eustache (un fermier antipathique qui adore effrayer Courage la plupart du temps à l'aide d'un masque de monstre). Courage, Eustache et Murielle sont fréquemment menacés par des monstres, des extraterrestres, démons, scientifiques fous, zombies, et autres types d'antagonistes dont Courage doit sauver ses maîtres. Parmi les créatures auxquelles ces trois personnages doivent faire face, certains d'entre eux étaient en détresse et cherchaient simplement à être aidés.
Muriel, Eustache, et Courage s'arrêtent dans un motel pour y passer la nuit. Néanmoins, Katz, le réceptionniste tente de les donner à manger à ses araignées domestiques.
Un renard prépare un délicieux ragoût de mamie cajun dans le cadre d'un concours de cuisine, mais il lui manque un ingrédient : la mamie. Muriel arrive, Courage doit l'empêcher de finir dans la marmite.
Fred, le neveu de Muriel, vient lui rendre visite à la ferme. Courage et lui se retrouvent enfermés dans la salle de bain, ce qui angoisse beaucoup le chien froussard.
Les frères canards de l'espace kidnappent Muriel : ils sont venus à Nullepart pour sauver leur frère. Courage doit sauver Muriel, et finit par aider aussi les frères canards.
En creusant pour retrouver son yo-yo, Courage tombe sur une boîte fermée qui appartenait au défunt frère d'Eustache, Horst. Eustache tente de l'ouvrir, pensant y trouver l'argent de son frère, mais il n'y arrive pas. Il embauche un médium pour entrer en contact avec Horst.
Courage creuse des trous dans le jardin et rapporte à ses maîtres une pièce archéologique volée du tombeau du pharaon. Le vieux fermier veut la garder, déclenchant ainsi la colère du roi d'Égypte.
Un pauvre bossu demande l'hospitalité à Eustache, qui lui ferme la porte au nez. Il se réfugie dans la grange et devient l'ami de Courage puis de Muriel.
Un dieu des oies solitaire espionne Muriel depuis les cieux et décide qu'elle doit être sa reine. Il descend sur Terre pour lui faire la cour et l'emmener avec lui. Courage doit trouver un moyen de l'en empêcher.
Eustache et Courage doivent dîner dehors car Muriel est malade. Eustache commande un hamburger. Mais Courage découvre qu'il est composé d'aliments étranges.
À la suite du naufrage de leur bateau, Muriel, Courage et un fermier se trouvent sur une île déserte. Le seul habitant de l'île est Katz, qui gère une drôle de station thermale.
Un poulet extraterrestre sans tête est venu prendre sa revanche sur le chien. Il vole des têtes afin d'en trouver une à sa mesure et s'en prend à Muriel et à Courage.
Muriel s'occupe tendrement de son potager d'aubergines. Une armée d'hommes-aubergines apprend son intention de préparer un bon plat et planifie une contre-offensive.
Une tornade menace Nullepart. Muriel ne peut pas partir avec ses amis car elle est collée à sa chaise. Quand la tornade s'arrête, Courage retrouve une Muriel âgée de trois ans et demi.
Un cirque ambulant s'installe dans le jardin de Courage. Le grand Fusilli fait monter toute la famille sur scène et transforme tous ses acteurs en marionnettes de bois.